Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC150Q8NCX0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC150Q8NCX0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms