Protein–RNA interactions for Protein: Q86V40

TRABD2A, Metalloprotease TIKI1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2AQ86V40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRABD2AQ86V40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABD2AQ86V40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABD2AQ86V40 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2AQ86V40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms