Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM135Q86UB9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms