Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D4Q7Z3S7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 999.2 ms