Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARCQ7LC44 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARCQ7LC44 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms