Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAXIP1Q6ZW49 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAXIP1Q6ZW49 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms