Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCL17Q6UXB2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL17Q6UXB2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CXCL17Q6UXB2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL17Q6UXB2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms