Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d1Q60949 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d1Q60949 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d1Q60949 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms