RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176416.7

Usp2-206, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp2, Length 1,486 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2-206ENSMUST00000176416 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa49.82■■■■■ 5.57
Usp2-206ENSMUST00000176416 NischQ80TM9 1593 aa49.24■■■■■ 5.47
Usp2-206ENSMUST00000176416 Abcc9P70170 1546 aa47.68■■■■■ 5.22
Usp2-206ENSMUST00000176416 Abcc8B2RUS7 1588 aa47.5■■■■■ 5.19
Usp2-206ENSMUST00000176416 ScribQ80U72 1612 aa45.67■■■■■ 4.9
Usp2-206ENSMUST00000176416 NacadQ5SWP3 1504 aa44.29■■■■■ 4.68
Usp2-206ENSMUST00000176416 Kdm5dQ62240 1548 aa44.24■■■■■ 4.67
Usp2-206ENSMUST00000176416 Dcaf1Q80TR8 1506 aa43.83■■■■■ 4.61
Usp2-206ENSMUST00000176416 Sycp2Q9CUU3 1500 aa43.39■■■■■ 4.54
Usp2-206ENSMUST00000176416 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42.96■■■■■ 4.47
Usp2-206ENSMUST00000176416 Rhox8Q6VSS7 320 aa42.75■■■■■ 4.43
Usp2-206ENSMUST00000176416 BicraF8VPZ9 1578 aa42.73■■■■■ 4.43
Usp2-206ENSMUST00000176416 Ccdc180J3QNE4 1664 aa42.46■■■■■ 4.39
Usp2-206ENSMUST00000176416 Baz1aO88379 1555 aa42.37■■■■■ 4.37
Usp2-206ENSMUST00000176416 Crybg2B7ZCC2 1516 aa42.16■■■■■ 4.34
Usp2-206ENSMUST00000176416 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
Usp2-206ENSMUST00000176416 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
Usp2-206ENSMUST00000176416 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
Usp2-206ENSMUST00000176416 Smarca2Q6DIC0 1577 aa41.15■■■■■ 4.18
Usp2-206ENSMUST00000176416 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
Usp2-206ENSMUST00000176416 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa41.06■■■■■ 4.16
Usp2-206ENSMUST00000176416 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
Usp2-206ENSMUST00000176416 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40.83■■■■■ 4.13
Usp2-206ENSMUST00000176416 Rtl1Q7M732 1744 aa40.83■■■■■ 4.13
Usp2-206ENSMUST00000176416 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40.71■■■■■ 4.11
Usp2-206ENSMUST00000176416 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40.7■■■■■ 4.11
Usp2-206ENSMUST00000176416 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.44■■■■■ 4.06
Usp2-206ENSMUST00000176416 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40.31■■■■■ 4.04
Usp2-206ENSMUST00000176416 Fam135aQ6NS59 1506 aa40.23■■■■■ 4.03
Usp2-206ENSMUST00000176416 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40.21■■■■■ 4.03
Usp2-206ENSMUST00000176416 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa40.03■■■■■ 4
Usp2-206ENSMUST00000176416 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
Usp2-206ENSMUST00000176416 CftrP26361 1476 aa40■■■■□ 3.99
Usp2-206ENSMUST00000176416 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
Usp2-206ENSMUST00000176416 Synj1Q8CHC4 1574 aa39.96■■■■□ 3.99
Usp2-206ENSMUST00000176416 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa39.93■■■■□ 3.98
Usp2-206ENSMUST00000176416 Baz1bQ9Z277 1479 aa39.83■■■■□ 3.97
Usp2-206ENSMUST00000176416 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39.73■■■■□ 3.95
Usp2-206ENSMUST00000176416 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39.54■■■■□ 3.92
Usp2-206ENSMUST00000176416 Trim41Q5NCC3 630 aa39.4■■■■□ 3.9
Usp2-206ENSMUST00000176416 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
Usp2-206ENSMUST00000176416 Mrc2Q64449 1479 aa39.29■■■■□ 3.88
Usp2-206ENSMUST00000176416 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
Usp2-206ENSMUST00000176416 Kif15Q6P9L6 1387 aa38.87■■■■□ 3.81
Usp2-206ENSMUST00000176416 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38.81■■■■□ 3.8
Usp2-206ENSMUST00000176416 Cux2P70298 1426 aa38.79■■■■□ 3.8
Usp2-206ENSMUST00000176416 Golga3P55937 1487 aa38.67■■■■□ 3.78
Usp2-206ENSMUST00000176416 Top2bQ64511 1612 aa38.63■■■■□ 3.77
Usp2-206ENSMUST00000176416 Cngb1E1AZ71 1325 aa38.49■■■■□ 3.75
Usp2-206ENSMUST00000176416 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38.48■■■■□ 3.75
Usp2-206ENSMUST00000176416 TnnQ80Z71 1560 aa38.46■■■■□ 3.75
Usp2-206ENSMUST00000176416 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38.42■■■■□ 3.74
Usp2-206ENSMUST00000176416 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
Usp2-206ENSMUST00000176416 Cep164Q5DU05 1446 aa38.34■■■■□ 3.73
Usp2-206ENSMUST00000176416 Ccdc18Q640L5 1455 aa38.27■■■■□ 3.72
Usp2-206ENSMUST00000176416 Fmn1Q05860 1466 aa38.2■■■■□ 3.71
Usp2-206ENSMUST00000176416 Camsap1A2AHC3 1581 aa38.15■■■■□ 3.7
Usp2-206ENSMUST00000176416 Il27Q8K3I6 234 aa38.09■■■■□ 3.69
Usp2-206ENSMUST00000176416 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
Usp2-206ENSMUST00000176416 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
Usp2-206ENSMUST00000176416 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
Usp2-206ENSMUST00000176416 Crocc2F6XLV1 1638 aa37.87■■■■□ 3.65
Usp2-206ENSMUST00000176416 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
Usp2-206ENSMUST00000176416 Plb1Q3TTY0 1478 aa37.8■■■■□ 3.64
Usp2-206ENSMUST00000176416 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
Usp2-206ENSMUST00000176416 Grin2bQ01097 1482 aa37.64■■■■□ 3.62
Usp2-206ENSMUST00000176416 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa37.64■■■■□ 3.62
Usp2-206ENSMUST00000176416 Duox2A2AQ99 1517 aa37.61■■■■□ 3.61
Usp2-206ENSMUST00000176416 Ift140E9PY46 1464 aa37.55■■■■□ 3.6
Usp2-206ENSMUST00000176416 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
Usp2-206ENSMUST00000176416 Efcab5A0JP43 1406 aa37.38■■■■□ 3.57
Usp2-206ENSMUST00000176416 Rusc2Q80U22 1514 aa37.36■■■■□ 3.57
Usp2-206ENSMUST00000176416 Chic1Q8CBW7 227 aa37.34■■■■□ 3.57
Usp2-206ENSMUST00000176416 Samd9lQ69Z37 1561 aa37.34■■■■□ 3.57
Usp2-206ENSMUST00000176416 NrkQ9R0G8 1455 aa37.29■■■■□ 3.56
Usp2-206ENSMUST00000176416 Disp1Q3TDN0 1521 aa37.26■■■■□ 3.55
Usp2-206ENSMUST00000176416 Shroom2A2ALU4 1481 aa37.25■■■■□ 3.55
Usp2-206ENSMUST00000176416 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
Usp2-206ENSMUST00000176416 Shroom4Q1W617 1475 aa37.14■■■■□ 3.54
Usp2-206ENSMUST00000176416 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
Usp2-206ENSMUST00000176416 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37.11■■■■□ 3.53
Usp2-206ENSMUST00000176416 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa37.07■■■■□ 3.52
Usp2-206ENSMUST00000176416 Rad54l2Q99NG0 1466 aa37.03■■■■□ 3.52
Usp2-206ENSMUST00000176416 PtprkP35822 1457 aa37.02■■■■□ 3.52
Usp2-206ENSMUST00000176416 Dnajc5P60904 198 aa36.98■■■■□ 3.51
Usp2-206ENSMUST00000176416 Grin2aP35436 1464 aa36.97■■■■□ 3.51
Usp2-206ENSMUST00000176416 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36.96■■■■□ 3.51
Usp2-206ENSMUST00000176416 SynmQ70IV5 1561 aa36.89■■■■□ 3.5
Usp2-206ENSMUST00000176416 HrcG5E8J6 738 aa36.88■■■■□ 3.5
Usp2-206ENSMUST00000176416 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.5
Usp2-206ENSMUST00000176416 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
Usp2-206ENSMUST00000176416 Gpatch8A2A6A1 1505 aa36.8■■■■□ 3.48
Usp2-206ENSMUST00000176416 Zeb1Q64318 1117 aa36.77■■■■□ 3.48
Usp2-206ENSMUST00000176416 Pla2r1Q62028 1487 aa36.76■■■■□ 3.48
Usp2-206ENSMUST00000176416 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
Usp2-206ENSMUST00000176416 Npm2Q80W85 207 aa36.71■■■■□ 3.47
Usp2-206ENSMUST00000176416 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36.63■■■■□ 3.45
Usp2-206ENSMUST00000176416 Col17a1Q07563 1470 aa36.62■■■■□ 3.45
Usp2-206ENSMUST00000176416 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36.61■■■■□ 3.45
Usp2-206ENSMUST00000176416 Gab3Q8BSM5 595 aa36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46 ms