Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3BQ5T9A4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms