Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM78Q5T7P6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM78Q5T7P6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms