Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC36A3Q495N2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A3Q495N2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms