Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF9Q16594 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF9Q16594 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF9Q16594 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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