Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX1Q15475 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms