Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPP1R7Q15435 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R7Q15435 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP1R7Q15435 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms