Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM2Q15035 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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