Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERPUD1Q15011 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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