Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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UBE2V1Q13404 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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UBE2V1Q13404 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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UBE2V1Q13404 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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UBE2V1Q13404 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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UBE2V1Q13404 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2V1Q13404 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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UBE2V1Q13404 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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UBE2V1Q13404 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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UBE2V1Q13404 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2V1Q13404 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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