Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 PEX3YDR329C 1326 nt6.61□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YDL218WYDL218W 954 nt6.61□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 RPS3YNL178W 723 nt6.61□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 CCC2YDR270W 3015 nt6.61□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 ASN2YGR124W 1719 nt6.61□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 AMD2YDR242W 1650 nt6.61□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 EMP65YER140W 1671 nt6.61□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YDR015CYDR015C 240 nt6.6□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YOS9YDR057W 1629 nt6.6□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 RGT2YDL138W 2292 nt6.6□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 MAK31YCR020C-A 267 nt6.59□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 TIF2YJL138C 1188 nt6.59□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 TIF1YKR059W 1188 nt6.59□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YNL285WYNL285W 372 nt6.59□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 SEC23YPR181C 2307 nt6.59□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 AIM24YJR080C 1185 nt6.58□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 RIX7YLL034C 2514 nt6.58□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 KIN1YDR122W 3195 nt6.57□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 EFM1YHL039W 1758 nt6.57□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 SRF1YDL133W 1314 nt6.57□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 BUD32YGR262C 786 nt6.57□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 RPP1YHR062C 882 nt6.57□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 ECM14YHR132C 1293 nt6.57□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 PMT3YOR321W 2262 nt6.56□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 YOR389WYOR389W 1875 nt6.56□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 SIT4YDL047W 936 nt6.56□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 YET3YDL072C 612 nt6.55□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 CSM2YIL132C 642 nt6.55□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 YLR312CYLR312C 1197 nt6.55□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 ENV7YPL236C 1095 nt6.55□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 ILV1YER086W 1731 nt6.55□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 TRR1YDR353W 960 nt6.54□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 YLR123CYLR123C 330 nt6.54□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 ICL1YER065C 1674 nt6.54□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 GPA2YER020W 1350 nt6.54□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 ELP3YPL086C 1674 nt6.53□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 FZF1YGL254W 900 nt6.53□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 ECM19YLR390W 339 nt6.53□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 JNM1YMR294W 1122 nt6.53□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 CAF40YNL288W 1122 nt6.53□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 SKS1YPL026C 1509 nt6.53□□□□□ -1.36
CTF3Q12748 LCB3YJL134W 1230 nt6.52□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 RPS5YJR123W 678 nt6.52□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 GCV3YAL044C 513 nt6.52□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 OPI8YKR035C 642 nt6.52□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 RKI1YOR095C 777 nt6.52□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 YPL102CYPL102C 303 nt6.52□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 MCH1YDL054C 1461 nt6.52□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 NHA1YLR138W 2958 nt6.51□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 IRC7YFR055W 1023 nt6.51□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 SEN34YAR008W 828 nt6.51□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 SPS22YCL048W 1392 nt6.51□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 UTR2YEL040W 1404 nt6.5□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 CHS5YLR330W 2016 nt6.5□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 FRE5YOR384W 2085 nt6.5□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.5□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 PEX13YLR191W 1161 nt6.5□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 KTR1YOR099W 1182 nt6.5□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.5□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 ICL2YPR006C 1728 nt6.5□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 NSE5YML023C 1671 nt6.49□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 YNL165WYNL165W 1221 nt6.49□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 HRQ1YDR291W 3234 nt6.49□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 ADE17YMR120C 1779 nt6.49□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 EDC3YEL015W 1656 nt6.49□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 QCR8YJL166W 285 nt6.48□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 POP5YAL033W 522 nt6.48□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 UTP4YDR324C 2331 nt6.48□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 EXG1YLR300W 1347 nt6.48□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 YDL144CYDL144C 1071 nt6.47□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 LDS1YAL018C 978 nt6.47□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 YMC1YPR058W 924 nt6.47□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 NMD5YJR132W 3147 nt6.47□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 RQC1YDR333C 2172 nt6.47□□□□□ -1.37
CTF3Q12748 IES2YNL215W 963 nt6.46□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 RRS1YOR294W 612 nt6.46□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 ATF1YOR377W 1578 nt6.46□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 CMR1YDL156W 1569 nt6.45□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 TMT1YER175C 900 nt6.45□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 COX5AYNL052W 462 nt6.45□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 TFC6YDR362C 2019 nt6.45□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 TKL2YBR117C 2046 nt6.45□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 MNS1YJR131W 1650 nt6.45□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YFL052WYFL052W 1398 nt6.44□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 MEU1YLR017W 1014 nt6.44□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YLR126CYLR126C 756 nt6.44□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 SNN1YNL086W 309 nt6.44□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 GEF1YJR040W 2340 nt6.44□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 MDM31YHR194W 1740 nt6.44□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 SES1YDR023W 1389 nt6.44□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YCR061WYCR061W 1896 nt6.43□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 AGP2YBR132C 1791 nt6.43□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YPR204WYPR204W 3099 nt6.43□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YFR006WYFR006W 1608 nt6.43□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 MPA43YNL249C 1629 nt6.43□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 CDC34YDR054C 888 nt6.42□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 SUR7YML052W 909 nt6.42□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 MRPS16YPL013C 366 nt6.42□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 HST2YPL015C 1074 nt6.42□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 FET4YMR319C 1659 nt6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms