Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 MIP1YOR330C 3765 nt6.23□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 YHR140WYHR140W 720 nt6.23□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 LYS1YIR034C 1122 nt6.23□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 VMA3YEL027W 483 nt6.22□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 HSP12YFL014W 330 nt6.22□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 ERP5YHR110W 639 nt6.22□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 HMS2YJR147W 1077 nt6.22□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 CBT1YKL208W 816 nt6.22□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 YNL120CYNL120C 486 nt6.22□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 TFB4YPR056W 1017 nt6.22□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 FBA1YKL060C 1080 nt6.21□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 PET112YBL080C 1626 nt6.21□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 ERG8YMR220W 1356 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 YNL247WYNL247W 2304 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 CCT8YJL008C 1707 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 TRP1YDR007W 675 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 AIM20YIL158W 615 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 DID2YKR035W-A 615 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 MHT1YLL062C 975 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 CTF19YPL018W 1110 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 ARO10YDR380W 1908 nt6.2□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 THI2YBR240C 1353 nt6.19□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 VMA2YBR127C 1554 nt6.19□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 SGE1YPR198W 1632 nt6.19□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 CDC10YCR002C 969 nt6.19□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 GTT3YEL017W 1014 nt6.19□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 IRS4YKR019C 1848 nt6.19□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 ATG7YHR171W 1893 nt6.19□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 PEX3YDR329C 1326 nt6.19□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 KNS1YLL019C 2214 nt6.18□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 MSY1YPL097W 1479 nt6.18□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.18□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 YBL070CYBL070C 321 nt6.18□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 CCC2YDR270W 3015 nt6.18□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 AVT4YNL101W 2142 nt6.17□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 PMT3YOR321W 2262 nt6.17□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 COS6YGR295C 1146 nt6.17□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 RPP1YHR062C 882 nt6.17□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 SQT1YIR012W 1296 nt6.17□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 TPK1YJL164C 1194 nt6.16□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 MDE1YJR024C 735 nt6.16□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 TSR2YLR435W 618 nt6.16□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 YBR027CYBR027C 333 nt6.16□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 LDB16YCL005W 771 nt6.16□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 GPD2YOL059W 1323 nt6.16□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 PHO3YBR092C 1404 nt6.16□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 HEM2YGL040C 1029 nt6.15□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 YKL153WYKL153W 510 nt6.15□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 YKR045CYKR045C 552 nt6.15□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 SCS22YBL091C-A 528 nt6.15□□□□□ -1.42
NMD4Q12129 UIP5YKR044W 1332 nt6.15□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 ARE2YNR019W 1929 nt6.15□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.14□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 MED6YHR058C 888 nt6.14□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 AIM24YJR080C 1185 nt6.14□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 JJJ3YJR097W 519 nt6.14□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YNL200CYNL200C 741 nt6.14□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 SES1YDR023W 1389 nt6.14□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 GUS1YGL245W 2127 nt6.14□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YGR054WYGR054W 1929 nt6.13□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YJU2YKL095W 837 nt6.13□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 MSO1YNR049C 633 nt6.13□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 ECM31YBR176W 939 nt6.13□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 AIM17YHL021C 1398 nt6.13□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 ZWF1YNL241C 1518 nt6.13□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 UTR2YEL040W 1404 nt6.12□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 ATG18YFR021W 1503 nt6.12□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 COX5AYNL052W 462 nt6.12□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 NOP7YGR103W 1818 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 BNA5YLR231C 1362 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 OPI7YDR360W 435 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 SRY1YKL218C 981 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 MEH1YKR007W 555 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 SRL2YLR082C 1179 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YLR123CYLR123C 330 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YPL136WYPL136W 369 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 PRP40YKL012W 1752 nt6.11□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 PPT1YGR123C 1542 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 PTC3YBL056W 1407 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 CDS1YBR029C 1374 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 GTO3YMR251W 1101 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YBL112CYBL112C 318 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 RKI1YOR095C 777 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 RPO26YPR187W 468 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 SEC18YBR080C 2277 nt6.1□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 TKL2YBR117C 2046 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 NTE1YML059C 5040 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 ISC1YER019W 1434 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 EMW1YNL313C 2715 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 CEF1YMR213W 1773 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YPR204WYPR204W 3099 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 ECM2YBR065C 1095 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 PTC4YBR125C 1182 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 YMR279CYMR279C 1623 nt6.09□□□□□ -1.43
NMD4Q12129 NOG2YNR053C 1461 nt6.09□□□□□ -1.44
NMD4Q12129 PMP3YDR276C 168 nt6.08□□□□□ -1.44
NMD4Q12129 CUP2YGL166W 678 nt6.08□□□□□ -1.44
NMD4Q12129 NCS6YGL211W 1080 nt6.08□□□□□ -1.44
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