Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2orf54Q08AI8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C2orf54Q08AI8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms