Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 YSC83YHR017W 1158 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 RUF23RUF23 254 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 YOR200WYOR200W 399 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 MOD5YOR274W 1287 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 DOT1YDR440W 1749 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 CCT8YJL008C 1707 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 MKK1YOR231W 1527 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 HXK2YGL253W 1461 nt6.29□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 YMR279CYMR279C 1623 nt6.29□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 GPI11YDR302W 660 nt6.29□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 THI4YGR144W 981 nt6.29□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 FBA1YKL060C 1080 nt6.29□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 ERG1YGR175C 1491 nt6.28□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 COX9YDL067C 180 nt6.28□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 SEN34YAR008W 828 nt6.28□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 YLR312CYLR312C 1197 nt6.28□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 DSF1YEL070W 1509 nt6.28□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 YNR073CYNR073C 1509 nt6.28□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 KEL1YHR158C 3495 nt6.28□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 PPM2YOL141W 2088 nt6.27□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 COQ1YBR003W 1422 nt6.27□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 FAL1YDR021W 1200 nt6.27□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 LYS1YIR034C 1122 nt6.27□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 SGF29YCL010C 780 nt6.27□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 HXT15YDL245C 1704 nt6.26□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 HXT16YJR158W 1704 nt6.26□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 MGM101YJR144W 810 nt6.26□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 FPR3YML074C 1236 nt6.26□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 TSR3YOR006C 942 nt6.26□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 IVY1YDR229W 1362 nt6.26□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 YHR020WYHR020W 2067 nt6.26□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 STT3YGL022W 2157 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 AFG1YEL052W 1530 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 HVG1YER039C 750 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 NAS6YGR232W 687 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 TIF2YJL138C 1188 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 ATG36YJL185C 882 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 MOG1YJR074W 657 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 TIF1YKR059W 1188 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 YBL070CYBL070C 321 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 RFC4YOL094C 972 nt6.25□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 THI2YBR240C 1353 nt6.24□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 MPC2YHR162W 390 nt6.24□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 MSO1YNR049C 633 nt6.24□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 DFR1YOR236W 636 nt6.24□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 UIP4YPL186C 915 nt6.24□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 PYK2YOR347C 1521 nt6.24□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 MTC5YDR128W 3447 nt6.23□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 AAT2YLR027C 1257 nt6.23□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 ICT1YLR099C 1185 nt6.23□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 YPL257WYPL257W 582 nt6.23□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 ALT2YDR111C 1524 nt6.23□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 PXL1YKR090W 2121 nt6.23□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 YPR196WYPR196W 1413 nt6.23□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 HAS1YMR290C 1518 nt6.22□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 RPP1YHR062C 882 nt6.22□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 SQT1YIR012W 1296 nt6.22□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 YJR084WYJR084W 1272 nt6.22□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 VPS24YKL041W 675 nt6.22□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 YLR123CYLR123C 330 nt6.22□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 LYS21YDL131W 1323 nt6.22□□□□□ -1.41
RPN8Q08723 MRC1YCL061C 3291 nt6.21□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 VPS61YDR136C 573 nt6.2□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 ERP5YHR110W 639 nt6.2□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 MIA40YKL195W 1212 nt6.2□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 SNN1YNL086W 309 nt6.2□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 MSY1YPL097W 1479 nt6.2□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 SRL2YLR082C 1179 nt6.19□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 PRP24YMR268C 1335 nt6.19□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 YFL042CYFL042C 2025 nt6.18□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 VPS5YOR069W 2028 nt6.18□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 PTC3YBL056W 1407 nt6.18□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 EDE1YBL047C 4146 nt6.18□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 DMA1YHR115C 1251 nt6.18□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 YML133CYML133C 4125 nt6.18□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 PDR18YNR070W 4002 nt6.17□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 CRF1YDR223W 1404 nt6.17□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 RVB2YPL235W 1416 nt6.17□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 BZZ1YHR114W 1902 nt6.17□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 YOL036WYOL036W 2286 nt6.17□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 MRPS12YNR036C 462 nt6.17□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 HIS7YBR248C 1659 nt6.17□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 PGM1YKL127W 1713 nt6.16□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 YDL172CYDL172C 480 nt6.16□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 ARA2YMR041C 1008 nt6.16□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 MPA43YNL249C 1629 nt6.16□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 CCC2YDR270W 3015 nt6.16□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 ARE2YNR019W 1929 nt6.15□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 SIT4YDL047W 936 nt6.15□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 MRPL1YDR116C 858 nt6.15□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 YHL018WYHL018W 363 nt6.15□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 EFM3YJR129C 1020 nt6.15□□□□□ -1.42
RPN8Q08723 YJR146WYJR146W 354 nt6.15□□□□□ -1.42
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