Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 GPD1YDL022W 1176 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 ASF1YJL115W 840 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 URA1YKL216W 945 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 LDB7YBL006C 543 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 COQ3YOL096C 939 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 RKI1YOR095C 777 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 LDB16YCL005W 771 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 HAS1YMR290C 1518 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.36□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 VMA3YEL027W 483 nt5.36□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 FMO1YHR176W 1299 nt5.36□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 MDE1YJR024C 735 nt5.36□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 FAT3YKL187C 2253 nt5.36□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 BIO3YNR058W 1443 nt5.35□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 CRP1YHR146W 1398 nt5.35□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 DMA1YHR115C 1251 nt5.35□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 CIS3YJL158C 684 nt5.35□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 TAF9YMR236W 474 nt5.35□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 PLB3YOL011W 2061 nt5.35□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 CRH1YGR189C 1524 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 MRPL35YDR322W 1104 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 NAS6YGR232W 687 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 DID2YKR035W-A 615 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 COS10YNR075W 1125 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 CPA1YOR303W 1236 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 CTF19YPL018W 1110 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 ARG81YML099C 2643 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 IRS4YKR019C 1848 nt5.34□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 CYS4YGR155W 1524 nt5.33□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 HEM2YGL040C 1029 nt5.33□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 SPG1YGR236C 288 nt5.33□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 ALT1YLR089C 1779 nt5.33□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 IMA5YJL216C 1746 nt5.33□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 ICS3YJL077C 396 nt5.32□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 QCR8YJL166W 285 nt5.32□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 YLR312CYLR312C 1197 nt5.32□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 MRPS18YNL306W 654 nt5.32□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 ECM31YBR176W 939 nt5.32□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 YML133CYML133C 4125 nt5.32□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 MPH3YJR160C 1809 nt5.32□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 FLC3YGL139W 2409 nt5.32□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 HSP104YLL026W 2727 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 VPS61YDR136C 573 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 LCL3YGL085W 825 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 OAC1YKL120W 975 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 MEH1YKR007W 555 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 PSR2YLR019W 1194 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 YML6YML025C 861 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 LSC1YOR142W 990 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 CCT8YJL008C 1707 nt5.31□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 LCB3YJL134W 1230 nt5.3□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 MOD5YOR274W 1287 nt5.3□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 AFG1YEL052W 1530 nt5.29□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 ARE2YNR019W 1929 nt5.29□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 OM45YIL136W 1182 nt5.29□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 POP5YAL033W 522 nt5.29□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 PEX13YLR191W 1161 nt5.29□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 KTR1YOR099W 1182 nt5.29□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 GPT2YKR067W 2232 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 SAL1YNL083W 1485 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 MRPL1YDR116C 858 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 COX20YDR231C 618 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 IES2YNL215W 963 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 BSC4YNL269W 396 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 YGR054WYGR054W 1929 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 MTC5YDR128W 3447 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 PPT1YGR123C 1542 nt5.28□□□□□ -1.56
HRD1Q08109 PDR18YNR070W 4002 nt5.27□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 GCG1YER163C 699 nt5.27□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 PGM1YKL127W 1713 nt5.27□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 ASN1YPR145W 1719 nt5.27□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 TPO3YPR156C 1869 nt5.27□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 VBA1YMR088C 1689 nt5.27□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 GUP2YPL189W 1830 nt5.26□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 GPI11YDR302W 660 nt5.26□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 SHO1YER118C 1104 nt5.26□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 PAB1YER165W 1734 nt5.26□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 MHT1YLL062C 975 nt5.25□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 DUS4YLR405W 1104 nt5.25□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 PUS4YNL292W 1212 nt5.25□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 MSO1YNR049C 633 nt5.25□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 PAP2YOL115W 1755 nt5.24□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 POX1YGL205W 2247 nt5.24□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 HRQ1YDR291W 3234 nt5.24□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 MCM6YGL201C 3054 nt5.24□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 YJL171CYJL171C 1191 nt5.24□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 SRL2YLR082C 1179 nt5.24□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 GTO3YMR251W 1101 nt5.24□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 AAP1YHR047C 2571 nt5.24□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 YIR007WYIR007W 2295 nt5.23□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 GAA1YLR088W 1845 nt5.23□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 YMC1YPR058W 924 nt5.23□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 RPL21AYBR191W 483 nt5.23□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 ERG8YMR220W 1356 nt5.23□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 EIS1YMR031C 2532 nt5.23□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 EXG1YLR300W 1347 nt5.23□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 SET5YHR207C 1581 nt5.22□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 PTC4YBR125C 1182 nt5.22□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 YBR226CYBR226C 411 nt5.22□□□□□ -1.57
HRD1Q08109 PTC3YBL056W 1407 nt5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.9 ms