Protein–RNA interactions for Protein: Q04301

VBA1, Vacuolar basic amino acid transporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA1Q04301 KTR1YOR099W 1182 nt5.58□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 MRPL23YOR150W 492 nt5.58□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 FIT2YOR382W 462 nt5.58□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 YPR076WYPR076W 375 nt5.58□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 RPL21AYBR191W 483 nt5.58□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 YFL042CYFL042C 2025 nt5.58□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 YJL163CYJL163C 1668 nt5.57□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 YGR127WYGR127W 939 nt5.57□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 PUP2YGR253C 783 nt5.57□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 CLB2YPR119W 1476 nt5.57□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 PGK1YCR012W 1251 nt5.56□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.56□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 MRS1YIR021W 1092 nt5.56□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 PAP2YOL115W 1755 nt5.56□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 IVY1YDR229W 1362 nt5.55□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 YGR054WYGR054W 1929 nt5.55□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 YOX1YML027W 1158 nt5.55□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 MRPS12YNR036C 462 nt5.55□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 HST2YPL015C 1074 nt5.55□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 FMP40YPL222W 2067 nt5.55□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 MFG1YDL233W 1377 nt5.55□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 YHK8YHR048W 1545 nt5.54□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 CNE1YAL058W 1509 nt5.54□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 VPS4YPR173C 1314 nt5.54□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 LAT1YNL071W 1449 nt5.54□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 HRQ1YDR291W 3234 nt5.53□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 MSN2YMR037C 2115 nt5.53□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 IME2YJL106W 1938 nt5.53□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 TMT1YER175C 900 nt5.53□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 LYS1YIR034C 1122 nt5.53□□□□□ -1.52
VBA1Q04301 PPH21YDL134C 1110 nt5.52□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 AGX1YFL030W 1158 nt5.52□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 RPL7AYGL076C 735 nt5.52□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YRB2YIL063C 984 nt5.52□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 SML1YML058W 315 nt5.52□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 RUF23RUF23 254 nt5.52□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 DAP1YPL170W 459 nt5.52□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 RPL7BYPL198W 735 nt5.52□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 HXT15YDL245C 1704 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 HXT16YJR158W 1704 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 PAT1YCR077C 2391 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 IRS4YKR019C 1848 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 ARE2YNR019W 1929 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 THI4YGR144W 981 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 ERP2YAL007C 648 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 POP5YAL033W 522 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 MEH1YKR007W 555 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YOL163WYOL163W 510 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 ECM31YBR176W 939 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 AMA1YGR225W 1782 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 PTK2YJR059W 2457 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 PYC2YBR218C 3543 nt5.51□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 MNN5YJL186W 1761 nt5.5□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 PET112YBL080C 1626 nt5.5□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 BZZ1YHR114W 1902 nt5.5□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 RIX7YLL034C 2514 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YGL235WYGL235W 537 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YAR064WYAR064W 300 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 RNH1YMR234W 1047 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 PRE5YMR314W 705 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YOL046CYOL046C 675 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 ASR1YPR093C 867 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 KEX2YNL238W 2445 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 EMW1YNL313C 2715 nt5.49□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 KDX1YKL161C 1302 nt5.48□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 HXK2YGL253W 1461 nt5.48□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 RPR1RPR1 369 nt5.48□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 FRE5YOR384W 2085 nt5.47□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 NMT1YLR195C 1368 nt5.47□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YTP1YNL237W 1380 nt5.47□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 ZIM17YNL310C 525 nt5.47□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 VMA4YOR332W 702 nt5.47□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YTH1YPR107C 627 nt5.47□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 COX15YER141W 1461 nt5.46□□□□□ -1.53
VBA1Q04301 YKL102CYKL102C 306 nt5.46□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 CTF19YPL018W 1110 nt5.46□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 YMC1YPR058W 924 nt5.46□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.46□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 HXT17YNR072W 1695 nt5.46□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 ALD6YPL061W 1503 nt5.45□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 VMA3YEL027W 483 nt5.45□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 RPE1YJL121C 717 nt5.45□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 CLB1YGR108W 1416 nt5.45□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 DEF1YKL054C 2217 nt5.44□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 TEP1YNL128W 1305 nt5.44□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 MSS1YMR023C 1581 nt5.43□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 SRL2YLR082C 1179 nt5.43□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 YOR268CYOR268C 399 nt5.43□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 LGE1YPL055C 999 nt5.43□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 TFB4YPR056W 1017 nt5.43□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 IFA38YBR159W 1044 nt5.43□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 AMD2YDR242W 1650 nt5.43□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 EXG1YLR300W 1347 nt5.43□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 HIR1YBL008W 2523 nt5.42□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 YDL023CYDL023C 321 nt5.42□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.42□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 CCT8YJL008C 1707 nt5.42□□□□□ -1.54
VBA1Q04301 SLX5YDL013W 1860 nt5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.3 ms