Protein–RNA interactions for Protein: Q02948

VPS30, Vacuolar protein sorting-associated protein 30, yeastyeast

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS30Q02948 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 YJR146WYJR146W 354 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 URE2YNL229C 1065 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 MRPL10YNL284C 969 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 COA2YPL189C-A 207 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 HBN1YCL026C-B 582 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 AVT4YNL101W 2142 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS30Q02948 MIP1YOR330C 3765 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 MMS21YEL019C 804 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 ARC35YNR035C 1029 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 DFR1YOR236W 636 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 OPI11YPR044C 354 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 POX1YGL205W 2247 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 PTC3YBL056W 1407 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 ARP3YJR065C 1350 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 ARE2YNR019W 1929 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 ELP3YPL086C 1674 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YBR241CYBR241C 1467 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 CCT3YJL014W 1605 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YEL074WYEL074W 339 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 RRP46YGR095C 672 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 SRL2YLR082C 1179 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YPR196WYPR196W 1413 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 BDF2YDL070W 1917 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YLL066CYLL066C 3618 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YGR054WYGR054W 1929 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 RUF23RUF23 254 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 CEF1YMR213W 1773 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 PHO3YBR092C 1404 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YHP1YDR451C 1062 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 ERP2YAL007C 648 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 VPS24YKL041W 675 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 TAH11YJR046W 1815 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 MIA40YKL195W 1212 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 SUR7YML052W 909 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 OGG1YML060W 1131 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 PTC4YBR125C 1182 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 KNS1YLL019C 2214 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 DSF1YEL070W 1509 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YNR073CYNR073C 1509 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 HSP12YFL014W 330 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 ORM1YGR038W 669 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YHL018WYHL018W 363 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 MED6YHR058C 888 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 MRPL24YMR193W 777 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 GTO3YMR251W 1101 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 ATP4YPL078C 735 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 DAL4YIR028W 1908 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 EDE1YBL047C 4146 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS30Q02948 PRE3YJL001W 648 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 TAF4YMR005W 1167 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 KSH1YNL024C-A 219 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 YBR284WYBR284W 2394 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 GSH1YJL101C 2037 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 HVG1YER039C 750 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 COQ3YOL096C 939 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 GPH1YPR160W 2709 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 ATG23YLR431C 1362 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 HEM2YGL040C 1029 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 MDE1YJR024C 735 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 MRPL36YBR122C 534 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 YIL055CYIL055C 1884 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 RRP1YDR087C 837 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 SDH4YDR178W 546 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 GCN3YKR026C 918 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 YNL120CYNL120C 486 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 YNR014WYNR014W 639 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 LSM12YHR121W 564 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 FPR3YML074C 1236 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 GLC8YMR311C 690 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 RPS28AYOR167C 204 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 ADH5YBR145W 1056 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 ISC1YER019W 1434 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 RVB2YPL235W 1416 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 ERG1YGR175C 1491 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 HEM1YDR232W 1647 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 PSR2YLR019W 1194 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 SLD7YOR060C 774 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 DSE3YOR264W 1293 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 LDB16YCL005W 771 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 PEX31YGR004W 1389 nt7.21□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 CDS1YBR029C 1374 nt7.21□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 POP1YNL221C 2628 nt7.21□□□□□ -1.25
VPS30Q02948 YDR401WYDR401W 564 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS30Q02948 REV7YIL139C 738 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS30Q02948 YDR415CYDR415C 1125 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS30Q02948 YPT1YFL038C 621 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS30Q02948 YUR1YJL139C 1287 nt7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.9 ms