Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A2Q02221 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6A2Q02221 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6A2Q02221 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms