Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HBA1P69905 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HBA1P69905 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HBA1P69905 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HBA1P69905 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HBA1P69905 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HBA1P69905 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HBA1P69905 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HBA1P69905 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HBA1P69905 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HBA1P69905 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HBA1P69905 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HBA1P69905 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HBA1P69905 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HBA1P69905 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HBA1P69905 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HBA1P69905 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HBA1P69905 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HBA1P69905 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HBA1P69905 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HBA1P69905 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HBA1P69905 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HBA1P69905 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HBA1P69905 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HBA1P69905 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HBA1P69905 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HBA1P69905 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HBA1P69905 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HBA1P69905 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HBA1P69905 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HBA1P69905 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HBA1P69905 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HBA1P69905 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HBA1P69905 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HBA1P69905 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HBA1P69905 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HBA1P69905 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HBA1P69905 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HBA1P69905 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HBA1P69905 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HBA1P69905 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HBA1P69905 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HBA1P69905 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HBA1P69905 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HBA1P69905 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HBA1P69905 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HBA1P69905 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HBA1P69905 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HBA1P69905 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms