Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTG1P63261 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTG1P63261 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms