Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFM1P61960 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFM1P61960 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFM1P61960 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFM1P61960 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFM1P61960 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFM1P61960 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFM1P61960 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFM1P61960 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFM1P61960 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFM1P61960 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFM1P61960 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFM1P61960 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UFM1P61960 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UFM1P61960 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UFM1P61960 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UFM1P61960 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UFM1P61960 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UFM1P61960 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UFM1P61960 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFM1P61960 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFM1P61960 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFM1P61960 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFM1P61960 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFM1P61960 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFM1P61960 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFM1P61960 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFM1P61960 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFM1P61960 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFM1P61960 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFM1P61960 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFM1P61960 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFM1P61960 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFM1P61960 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFM1P61960 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UFM1P61960 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFM1P61960 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFM1P61960 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFM1P61960 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFM1P61960 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFM1P61960 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UFM1P61960 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFM1P61960 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFM1P61960 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFM1P61960 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFM1P61960 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFM1P61960 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFM1P61960 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFM1P61960 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFM1P61960 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFM1P61960 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFM1P61960 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFM1P61960 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFM1P61960 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFM1P61960 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFM1P61960 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFM1P61960 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFM1P61960 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UFM1P61960 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFM1P61960 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFM1P61960 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFM1P61960 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UFM1P61960 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFM1P61960 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFM1P61960 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFM1P61960 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UFM1P61960 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UFM1P61960 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UFM1P61960 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UFM1P61960 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFM1P61960 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFM1P61960 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms