Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP1P56182 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP1P56182 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP1P56182 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1P56182 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1P56182 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1P56182 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1P56182 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1P56182 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1P56182 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1P56182 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1P56182 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1P56182 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1P56182 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1P56182 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1P56182 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1P56182 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP1P56182 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP1P56182 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP1P56182 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP1P56182 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP1P56182 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP1P56182 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP1P56182 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP1P56182 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP1P56182 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP1P56182 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP1P56182 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP1P56182 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP1P56182 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RRP1P56182 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP1P56182 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP1P56182 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP1P56182 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1P56182 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1P56182 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1P56182 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1P56182 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1P56182 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1P56182 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1P56182 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1P56182 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1P56182 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1P56182 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1P56182 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1P56182 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1P56182 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1P56182 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1P56182 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1P56182 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1P56182 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1P56182 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1P56182 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP1P56182 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP1P56182 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP1P56182 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1P56182 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1P56182 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1P56182 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1P56182 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1P56182 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1P56182 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP1P56182 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP1P56182 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP1P56182 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP1P56182 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP1P56182 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP1P56182 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP1P56182 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP1P56182 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP1P56182 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP1P56182 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP1P56182 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP1P56182 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP1P56182 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP1P56182 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP1P56182 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP1P56182 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP1P56182 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP1P56182 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP1P56182 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP1P56182 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP1P56182 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP1P56182 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP1P56182 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RRP1P56182 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RRP1P56182 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP1P56182 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP1P56182 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms