Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERFP50548 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERFP50548 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERFP50548 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERFP50548 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERFP50548 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERFP50548 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERFP50548 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERFP50548 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERFP50548 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERFP50548 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERFP50548 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERFP50548 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERFP50548 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERFP50548 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERFP50548 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERFP50548 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERFP50548 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERFP50548 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERFP50548 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERFP50548 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERFP50548 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERFP50548 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERFP50548 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERFP50548 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERFP50548 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERFP50548 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERFP50548 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERFP50548 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERFP50548 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERFP50548 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERFP50548 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERFP50548 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERFP50548 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERFP50548 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERFP50548 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERFP50548 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERFP50548 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERFP50548 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERFP50548 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERFP50548 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERFP50548 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERFP50548 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERFP50548 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERFP50548 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERFP50548 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERFP50548 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERFP50548 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERFP50548 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERFP50548 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERFP50548 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERFP50548 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERFP50548 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERFP50548 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERFP50548 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERFP50548 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERFP50548 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERFP50548 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERFP50548 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERFP50548 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERFP50548 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERFP50548 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERFP50548 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERFP50548 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERFP50548 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERFP50548 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERFP50548 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERFP50548 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERFP50548 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERFP50548 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERFP50548 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERFP50548 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERFP50548 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERFP50548 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERFP50548 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERFP50548 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERFP50548 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERFP50548 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERFP50548 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERFP50548 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms