Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTPAP49638 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTPAP49638 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTPAP49638 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTPAP49638 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTPAP49638 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTPAP49638 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTPAP49638 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTPAP49638 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTPAP49638 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTPAP49638 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTPAP49638 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTPAP49638 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTPAP49638 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTPAP49638 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTPAP49638 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTPAP49638 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTPAP49638 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTPAP49638 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTPAP49638 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTPAP49638 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTPAP49638 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTPAP49638 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTPAP49638 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTPAP49638 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTPAP49638 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTPAP49638 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTPAP49638 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTPAP49638 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTPAP49638 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTPAP49638 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTPAP49638 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTPAP49638 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTPAP49638 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTPAP49638 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTPAP49638 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTPAP49638 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTPAP49638 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTPAP49638 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTPAP49638 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTPAP49638 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTPAP49638 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTPAP49638 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTPAP49638 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTPAP49638 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTPAP49638 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTPAP49638 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTPAP49638 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTPAP49638 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTPAP49638 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTPAP49638 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTPAP49638 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTPAP49638 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTPAP49638 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTPAP49638 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTPAP49638 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTPAP49638 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTPAP49638 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTPAP49638 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTPAP49638 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTPAP49638 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTPAP49638 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTPAP49638 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTPAP49638 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTPAP49638 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTPAP49638 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TTPAP49638 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTPAP49638 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTPAP49638 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTPAP49638 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTPAP49638 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTPAP49638 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTPAP49638 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TTPAP49638 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTPAP49638 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTPAP49638 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTPAP49638 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTPAP49638 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTPAP49638 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTPAP49638 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTPAP49638 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTPAP49638 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTPAP49638 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTPAP49638 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTPAP49638 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTPAP49638 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTPAP49638 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTPAP49638 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTPAP49638 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTPAP49638 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTPAP49638 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTPAP49638 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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