Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTAP49354 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTAP49354 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTAP49354 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTAP49354 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTAP49354 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTAP49354 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTAP49354 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTAP49354 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTAP49354 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTAP49354 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTAP49354 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTAP49354 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTAP49354 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTAP49354 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTAP49354 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTAP49354 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTAP49354 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTAP49354 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTAP49354 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTAP49354 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTAP49354 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTAP49354 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTAP49354 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTAP49354 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTAP49354 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTAP49354 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTAP49354 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNTAP49354 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FNTAP49354 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNTAP49354 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNTAP49354 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNTAP49354 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FNTAP49354 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNTAP49354 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTAP49354 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTAP49354 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTAP49354 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTAP49354 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTAP49354 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTAP49354 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTAP49354 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTAP49354 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTAP49354 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTAP49354 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTAP49354 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTAP49354 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTAP49354 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FNTAP49354 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTAP49354 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTAP49354 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTAP49354 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms