Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD97P48960 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD97P48960 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD97P48960 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD97P48960 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD97P48960 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD97P48960 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD97P48960 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD97P48960 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD97P48960 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD97P48960 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD97P48960 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD97P48960 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD97P48960 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD97P48960 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD97P48960 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD97P48960 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD97P48960 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD97P48960 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD97P48960 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD97P48960 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD97P48960 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD97P48960 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD97P48960 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD97P48960 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD97P48960 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD97P48960 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD97P48960 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD97P48960 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD97P48960 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD97P48960 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD97P48960 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD97P48960 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD97P48960 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD97P48960 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD97P48960 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD97P48960 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD97P48960 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD97P48960 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD97P48960 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD97P48960 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD97P48960 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD97P48960 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD97P48960 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD97P48960 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD97P48960 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD97P48960 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD97P48960 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD97P48960 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD97P48960 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD97P48960 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD97P48960 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD97P48960 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD97P48960 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms