Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 YHR095WYHR095W 495 nt6.01□□□□□ -1.45
PUS4P48567 ERV25YML012W 636 nt6.01□□□□□ -1.45
PUS4P48567 UTP9YHR196W 1728 nt6.01□□□□□ -1.45
PUS4P48567 CRP1YHR146W 1398 nt6.01□□□□□ -1.45
PUS4P48567 HRB1YNL004W 1365 nt6.01□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YLL066CYLL066C 3618 nt6.01□□□□□ -1.45
PUS4P48567 ATG32YIL146C 1590 nt6.01□□□□□ -1.45
PUS4P48567 GSH1YJL101C 2037 nt6.01□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YPQ2YDR352W 954 nt6□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YGR066CYGR066C 879 nt6□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YLL017WYLL017W 312 nt6□□□□□ -1.45
PUS4P48567 SPC24YMR117C 642 nt6□□□□□ -1.45
PUS4P48567 PPA2YMR267W 933 nt6□□□□□ -1.45
PUS4P48567 NPT1YOR209C 1290 nt6□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YPL014WYPL014W 1146 nt6□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YPC1YBR183W 951 nt6□□□□□ -1.45
PUS4P48567 CRF1YDR223W 1404 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 ASN1YPR145W 1719 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 HSP12YFL014W 330 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YJR142WYJR142W 1029 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 DAL80YKR034W 810 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YET2YMR040W 483 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 RPR1RPR1 369 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 RPC19YNL113W 429 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 snR34snR34 203 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 UGO1YDR470C 1509 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 OSM1YJR051W 1506 nt5.99□□□□□ -1.45
PUS4P48567 snR57snR57 88 nt5.98□□□□□ -1.45
PUS4P48567 OPI8YKR035C 642 nt5.98□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YLR358CYLR358C 564 nt5.98□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YMR114CYMR114C 1107 nt5.98□□□□□ -1.45
PUS4P48567 AFG3YER017C 2286 nt5.98□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YDR541CYDR541C 1035 nt5.97□□□□□ -1.45
PUS4P48567 OSW5YMR148W 447 nt5.97□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YPR109WYPR109W 885 nt5.97□□□□□ -1.45
PUS4P48567 HBN1YCL026C-B 582 nt5.97□□□□□ -1.45
PUS4P48567 CEF1YMR213W 1773 nt5.97□□□□□ -1.45
PUS4P48567 HXK2YGL253W 1461 nt5.96□□□□□ -1.45
PUS4P48567 YLH47YPR125W 1365 nt5.96□□□□□ -1.45
PUS4P48567 DHH1YDL160C 1521 nt5.96□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.96□□□□□ -1.46
PUS4P48567 SPS1YDR523C 1473 nt5.96□□□□□ -1.46
PUS4P48567 LDB19YOR322C 2457 nt5.96□□□□□ -1.46
PUS4P48567 CIT2YCR005C 1383 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 HIS7YBR248C 1659 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 HST4YDR191W 1113 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 PIH1YHR034C 1035 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YIL055CYIL055C 1884 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 BMT5YIL096C 1011 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 SUN4YNL066W 1263 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 POP1YNL221C 2628 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 FRE7YOL152W 1863 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 BDS1YOL164W 1941 nt5.95□□□□□ -1.46
PUS4P48567 NFI1YOR156C 2181 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 FHL1YPR104C 2811 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 MPC54YOR177C 1395 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 LAP2YNL045W 2016 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 GPH1YPR160W 2709 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 QRI1YDL103C 1434 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 ISC1YER019W 1434 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 PUP2YGR253C 783 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YJR107WYJR107W 987 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 CCP1YKR066C 1086 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 MSA2YKR077W 1092 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 VTA1YLR181C 993 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 TUB1YML085C 1344 nt5.94□□□□□ -1.46
PUS4P48567 CCT3YJL014W 1605 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YUR1YJL139C 1287 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 APN1YKL114C 1104 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 SKG1YKR100C 1068 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 PTH2YBL057C 627 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YGP1YNL160W 1065 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 NDJ1YOL104C 1059 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 UBA3YPR066W 900 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 PEX32YBR168W 1242 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 VHS1YDR247W 1386 nt5.93□□□□□ -1.46
PUS4P48567 TDP1YBR223C 1635 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 LAT1YNL071W 1449 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 PXL1YKR090W 2121 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 NMA2YGR010W 1188 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 EFM3YJR129C 1020 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YKL169CYKL169C 384 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 REX3YLR107W 1215 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YML122CYML122C 381 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YBL029WYBL029W 1131 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 ATP23YNR020C 813 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 FES1YBR101C 873 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 PYK2YOR347C 1521 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 IMA2YOL157C 1770 nt5.92□□□□□ -1.46
PUS4P48567 PCL9YDL179W 915 nt5.91□□□□□ -1.46
PUS4P48567 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.91□□□□□ -1.46
PUS4P48567 UBC6YER100W 753 nt5.91□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YGR127WYGR127W 939 nt5.91□□□□□ -1.46
PUS4P48567 AVT4YNL101W 2142 nt5.91□□□□□ -1.46
PUS4P48567 GET4YOR164C 939 nt5.91□□□□□ -1.46
PUS4P48567 MRPL28YDR462W 444 nt5.9□□□□□ -1.46
PUS4P48567 YEL028WYEL028W 462 nt5.9□□□□□ -1.46
PUS4P48567 SKI8YGL213C 1194 nt5.9□□□□□ -1.46
PUS4P48567 PTC7YHR076W 1032 nt5.9□□□□□ -1.46
PUS4P48567 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.5 ms