Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP2P46087 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP2P46087 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP2P46087 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP2P46087 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP2P46087 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP2P46087 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP2P46087 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP2P46087 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP2P46087 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP2P46087 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP2P46087 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP2P46087 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP2P46087 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP2P46087 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP2P46087 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP2P46087 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP2P46087 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP2P46087 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP2P46087 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP2P46087 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP2P46087 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP2P46087 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP2P46087 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP2P46087 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP2P46087 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP2P46087 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP2P46087 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP2P46087 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP2P46087 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP2P46087 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP2P46087 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP2P46087 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP2P46087 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP2P46087 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP2P46087 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP2P46087 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP2P46087 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP2P46087 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP2P46087 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP2P46087 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP2P46087 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP2P46087 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP2P46087 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP2P46087 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP2P46087 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP2P46087 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP2P46087 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP2P46087 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP2P46087 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP2P46087 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP2P46087 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP2P46087 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP2P46087 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NOP2P46087 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP2P46087 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP2P46087 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP2P46087 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP2P46087 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP2P46087 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP2P46087 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP2P46087 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP2P46087 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP2P46087 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP2P46087 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP2P46087 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP2P46087 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP2P46087 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP2P46087 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP2P46087 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP2P46087 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP2P46087 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP2P46087 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP2P46087 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP2P46087 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP2P46087 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP2P46087 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP2P46087 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP2P46087 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP2P46087 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP2P46087 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP2P46087 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms