Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADSBP45954 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACADSBP45954 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms