Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC26A3P40879 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC26A3P40879 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms