Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YRB2YIL063C 984 nt5.87□□□□□ -1.47
DDI1P40087 LYS1YIR034C 1122 nt5.87□□□□□ -1.47
DDI1P40087 LCB3YJL134W 1230 nt5.87□□□□□ -1.47
DDI1P40087 POP5YAL033W 522 nt5.87□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YPR076WYPR076W 375 nt5.87□□□□□ -1.47
DDI1P40087 POX1YGL205W 2247 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YJL163CYJL163C 1668 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YDR278CYDR278C 318 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 FZF1YGL254W 900 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YIR042CYIR042C 711 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YAR064WYAR064W 300 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 RNH1YMR234W 1047 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YNL017CYNL017C 339 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YBL070CYBL070C 321 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 MRPL23YOR150W 492 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 RPL21AYBR191W 483 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 SCT1YBL011W 2280 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 VPS5YOR069W 2028 nt5.86□□□□□ -1.47
DDI1P40087 HSP104YLL026W 2727 nt5.85□□□□□ -1.47
DDI1P40087 PTK2YJR059W 2457 nt5.85□□□□□ -1.47
DDI1P40087 VPS4YPR173C 1314 nt5.85□□□□□ -1.47
DDI1P40087 COS10YNR075W 1125 nt5.85□□□□□ -1.47
DDI1P40087 AMA1YGR225W 1782 nt5.85□□□□□ -1.47
DDI1P40087 MPA43YNL249C 1629 nt5.85□□□□□ -1.47
DDI1P40087 PGK1YCR012W 1251 nt5.84□□□□□ -1.47
DDI1P40087 CYS3YAL012W 1185 nt5.84□□□□□ -1.47
DDI1P40087 EFM3YJR129C 1020 nt5.84□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YKL077WYKL077W 1179 nt5.84□□□□□ -1.47
DDI1P40087 MEH1YKR007W 555 nt5.84□□□□□ -1.47
DDI1P40087 RHO4YKR055W 876 nt5.84□□□□□ -1.47
DDI1P40087 CDC16YKL022C 2523 nt5.84□□□□□ -1.47
DDI1P40087 CLB2YPR119W 1476 nt5.83□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YGL235WYGL235W 537 nt5.83□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.83□□□□□ -1.48
DDI1P40087 RPR1RPR1 369 nt5.83□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YOL163WYOL163W 510 nt5.83□□□□□ -1.48
DDI1P40087 MRP51YPL118W 1035 nt5.83□□□□□ -1.48
DDI1P40087 ECM31YBR176W 939 nt5.83□□□□□ -1.48
DDI1P40087 MCM6YGL201C 3054 nt5.83□□□□□ -1.48
DDI1P40087 NSE5YML023C 1671 nt5.82□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YOL036WYOL036W 2286 nt5.82□□□□□ -1.48
DDI1P40087 MAK32YCR019W 1092 nt5.82□□□□□ -1.48
DDI1P40087 AGX1YFL030W 1158 nt5.82□□□□□ -1.48
DDI1P40087 SPG1YGR236C 288 nt5.82□□□□□ -1.48
DDI1P40087 PUP2YGR253C 783 nt5.82□□□□□ -1.48
DDI1P40087 GPB2YAL056W 2643 nt5.81□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YFL042CYFL042C 2025 nt5.81□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YML083CYML083C 1257 nt5.81□□□□□ -1.48
DDI1P40087 CRZ1YNL027W 2037 nt5.81□□□□□ -1.48
DDI1P40087 GDA1YEL042W 1557 nt5.8□□□□□ -1.48
DDI1P40087 SUB2YDL084W 1341 nt5.8□□□□□ -1.48
DDI1P40087 PPH21YDL134C 1110 nt5.8□□□□□ -1.48
DDI1P40087 VMA3YEL027W 483 nt5.8□□□□□ -1.48
DDI1P40087 MNN5YJL186W 1761 nt5.8□□□□□ -1.48
DDI1P40087 GPA2YER020W 1350 nt5.8□□□□□ -1.48
DDI1P40087 ALD6YPL061W 1503 nt5.79□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YMC1YPR058W 924 nt5.79□□□□□ -1.48
DDI1P40087 IFA38YBR159W 1044 nt5.79□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YGR054WYGR054W 1929 nt5.79□□□□□ -1.48
DDI1P40087 VPS70YJR126C 2436 nt5.79□□□□□ -1.48
DDI1P40087 TEL2YGR099W 2067 nt5.79□□□□□ -1.48
DDI1P40087 ATF1YOR377W 1578 nt5.79□□□□□ -1.48
DDI1P40087 PET112YBL080C 1626 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YKL102CYKL102C 306 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 GEP5YLR091W 882 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 YOX1YML027W 1158 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 GLN1YPR035W 1113 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 ASR1YPR093C 867 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 MKK2YPL140C 1521 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 ARE2YNR019W 1929 nt5.78□□□□□ -1.48
DDI1P40087 EXG1YLR300W 1347 nt5.77□□□□□ -1.49
DDI1P40087 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.77□□□□□ -1.49
DDI1P40087 URA1YKL216W 945 nt5.77□□□□□ -1.49
DDI1P40087 SML1YML058W 315 nt5.77□□□□□ -1.49
DDI1P40087 YOL046CYOL046C 675 nt5.77□□□□□ -1.49
DDI1P40087 CNE1YAL058W 1509 nt5.77□□□□□ -1.49
DDI1P40087 YIR007WYIR007W 2295 nt5.77□□□□□ -1.49
DDI1P40087 PCS60YBR222C 1632 nt5.77□□□□□ -1.49
DDI1P40087 PPT1YGR123C 1542 nt5.76□□□□□ -1.49
DDI1P40087 RPL7AYGL076C 735 nt5.76□□□□□ -1.49
DDI1P40087 CTF19YPL018W 1110 nt5.76□□□□□ -1.49
DDI1P40087 RPL7BYPL198W 735 nt5.76□□□□□ -1.49
DDI1P40087 SPS22YCL048W 1392 nt5.76□□□□□ -1.49
DDI1P40087 YPL277CYPL277C 1464 nt5.76□□□□□ -1.49
DDI1P40087 TEP1YNL128W 1305 nt5.75□□□□□ -1.49
DDI1P40087 SNU71YGR013W 1863 nt5.75□□□□□ -1.49
DDI1P40087 FMP40YPL222W 2067 nt5.75□□□□□ -1.49
DDI1P40087 BUD9YGR041W 1644 nt5.75□□□□□ -1.49
DDI1P40087 TMT1YER175C 900 nt5.75□□□□□ -1.49
DDI1P40087 AIM46YHR199C 933 nt5.75□□□□□ -1.49
DDI1P40087 HXT17YNR072W 1695 nt5.75□□□□□ -1.49
DDI1P40087 YFR006WYFR006W 1608 nt5.74□□□□□ -1.49
DDI1P40087 RPT3YDR394W 1287 nt5.74□□□□□ -1.49
DDI1P40087 VMA4YOR332W 702 nt5.74□□□□□ -1.49
DDI1P40087 CWC27YPL064C 906 nt5.74□□□□□ -1.49
DDI1P40087 YFL052WYFL052W 1398 nt5.74□□□□□ -1.49
DDI1P40087 PDR18YNR070W 4002 nt5.74□□□□□ -1.49
DDI1P40087 GEX1YCL073C 1848 nt5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.8 ms