Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACVR1BP36896 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms