Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF2P35227 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms