Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	YMR027W	YMR027W	1413 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SIP1	P32578	COX5A	YNL052W	462 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SIP1	P32578	NTG2	YOL043C	1143 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SIP1	P32578	MED4	YOR174W	855 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SIP1	P32578	YOR343C	YOR343C	327 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SIP1	P32578	DPM1	YPR183W	804 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SIP1	P32578	ALT2	YDR111C	1524 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SIP1	P32578	HRB1	YNL004W	1365 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SIP1	P32578	SUF5	tG(CCC)O	72 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	ICS3	YJL077C	396 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	SPC42	YKL042W	1092 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	GCN3	YKR026C	918 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	RRT7	YLL030C	342 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	HAS1	YMR290C	1518 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	PCS60	YBR222C	1632 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	GUS1	YGL245W	2127 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YDR132C	YDR132C	1488 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	RKM4	YDR257C	1485 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	PTR2	YKR093W	1806 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	BPL1	YDL141W	2073 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YFL013W-A	YFL013W-A	804 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	GTO1	YGR154C	1071 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YJR107W	YJR107W	987 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YKL018C-A	YKL018C-A	300 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	ADE1	YAR015W	921 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	PEX12	YMR026C	1200 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	MRPL36	YBR122C	534 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	CIT2	YCR005C	1383 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	KEL1	YHR158C	3495 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	AFG1	YEL052W	1530 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	PCL6	YER059W	1263 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	PIL1	YGR086C	1020 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	MAD2	YJL030W	591 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YDR514C	YDR514C	1452 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	NOP7	YGR103W	1818 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	DEF1	YKL054C	2217 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	COX9	YDL067C	180 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	PEX7	YDR142C	1128 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YKR032W	YKR032W	315 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	BUD20	YLR074C	501 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	snR34	snR34	203 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	AIM17	YHL021C	1398 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YGL081W	YGL081W	963 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	NMA2	YGR010W	1188 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YMR114C	YMR114C	1107 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	SPC24	YMR117C	642 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	MIP1	YOR330C	3765 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	IVY1	YDR229W	1362 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YGL072C	YGL072C	360 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	MRPL25	YGR076C	474 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	MED6	YHR058C	888 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	DBR1	YKL149C	1218 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	YNL234W	YNL234W	1281 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	ATP23	YNR020C	813 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	RPO26	YPR187W	468 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	SAC6	YDR129C	1929 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SIP1	P32578	IMG2	YCR071C	441 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	RTT103	YDR289C	1230 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	YDR476C	YDR476C	675 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	tL(UAA)B1	tL(UAA)B1	84 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	tL(UAA)B2	tL(UAA)B2	84 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	tL(UAA)D	tL(UAA)D	84 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	SUP51	tL(UAA)J	84 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	tL(UAA)K	tL(UAA)K	84 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	tL(UAA)L	tL(UAA)L	84 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	tL(UAA)N	tL(UAA)N	84 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	YGL235W	YGL235W	537 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	CBR1	YIL043C	855 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	RDL1	YOR285W	420 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	DUG1	YFR044C	1446 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	DDC1	YPL194W	1839 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	MTC5	YDR128W	3447 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	PAT1	YCR077C	2391 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	QNS1	YHR074W	2145 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	HSP150	YJL159W	1242 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	SRL2	YLR082C	1179 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	TOS6	YNL300W	309 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	NDJ1	YOL104C	1059 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	STB5	YHR178W	2232 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	TRS31	YDR472W	852 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	SUA5	YGL169W	1281 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	YAL016C-A	YAL016C-A	315 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	LSG1	YGL099W	1923 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	YML133C	YML133C	4125 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	VPS72	YDR485C	2388 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	VMS1	YDR049W	1899 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	DML1	YMR211W	1428 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	SKN1	YGR143W	2316 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	SOH1	YGL127C	384 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	NCS6	YGL211W	1080 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	FUS3	YBL016W	1062 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	URE2	YNL229C	1065 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	RPS28A	YOR167C	204 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	SAL1	YNL083W	1485 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	YEL020C	YEL020C	1683 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	CLD1	YGR110W	1338 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	GPT2	YKR067W	2232 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SIP1	P32578	PMT3	YOR321W	2262 nt		5.67	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms