Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP5DP30049 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms