Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR1P25024 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCR1P25024 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms