Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB3P16520 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB3P16520 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB3P16520 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB3P16520 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB3P16520 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB3P16520 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB3P16520 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB3P16520 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB3P16520 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB3P16520 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB3P16520 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB3P16520 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB3P16520 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB3P16520 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB3P16520 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB3P16520 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB3P16520 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GNB3P16520 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GNB3P16520 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GNB3P16520 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GNB3P16520 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GNB3P16520 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB3P16520 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB3P16520 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB3P16520 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB3P16520 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB3P16520 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB3P16520 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB3P16520 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB3P16520 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB3P16520 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB3P16520 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB3P16520 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB3P16520 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB3P16520 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB3P16520 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB3P16520 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB3P16520 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB3P16520 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB3P16520 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB3P16520 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB3P16520 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB3P16520 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB3P16520 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB3P16520 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB3P16520 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB3P16520 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB3P16520 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB3P16520 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB3P16520 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB3P16520 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB3P16520 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB3P16520 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GNB3P16520 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
GNB3P16520 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB3P16520 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB3P16520 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB3P16520 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB3P16520 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB3P16520 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB3P16520 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB3P16520 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB3P16520 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB3P16520 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB3P16520 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB3P16520 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB3P16520 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB3P16520 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB3P16520 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB3P16520 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB3P16520 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB3P16520 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB3P16520 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB3P16520 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB3P16520 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms