Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAFP15056 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAFP15056 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAFP15056 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAFP15056 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAFP15056 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAFP15056 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAFP15056 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAFP15056 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAFP15056 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAFP15056 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAFP15056 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAFP15056 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAFP15056 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAFP15056 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAFP15056 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAFP15056 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAFP15056 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAFP15056 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAFP15056 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAFP15056 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAFP15056 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAFP15056 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAFP15056 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAFP15056 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAFP15056 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAFP15056 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAFP15056 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAFP15056 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAFP15056 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAFP15056 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRAFP15056 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRAFP15056 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAFP15056 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAFP15056 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAFP15056 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAFP15056 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAFP15056 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAFP15056 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAFP15056 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAFP15056 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAFP15056 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAFP15056 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAFP15056 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAFP15056 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAFP15056 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAFP15056 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAFP15056 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAFP15056 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAFP15056 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAFP15056 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAFP15056 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAFP15056 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAFP15056 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAFP15056 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAFP15056 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAFP15056 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAFP15056 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAFP15056 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAFP15056 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAFP15056 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAFP15056 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAFP15056 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAFP15056 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAFP15056 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAFP15056 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAFP15056 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAFP15056 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAFP15056 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAFP15056 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAFP15056 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAFP15056 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAFP15056 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAFP15056 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAFP15056 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAFP15056 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAFP15056 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRAFP15056 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAFP15056 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAFP15056 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAFP15056 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAFP15056 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAFP15056 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAFP15056 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAFP15056 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAFP15056 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAFP15056 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAFP15056 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAFP15056 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAFP15056 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAFP15056 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAFP15056 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAFP15056 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAFP15056 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAFP15056 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAFP15056 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAFP15056 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAFP15056 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAFP15056 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAFP15056 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms