Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL6A2P12110 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms