Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC175P0C221 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC175P0C221 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC175P0C221 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms