Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA4P06727 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA4P06727 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA4P06727 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA4P06727 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA4P06727 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA4P06727 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA4P06727 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA4P06727 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA4P06727 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA4P06727 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA4P06727 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA4P06727 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA4P06727 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA4P06727 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA4P06727 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA4P06727 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA4P06727 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA4P06727 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA4P06727 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA4P06727 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA4P06727 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOA4P06727 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA4P06727 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA4P06727 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA4P06727 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA4P06727 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA4P06727 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA4P06727 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA4P06727 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA4P06727 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA4P06727 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA4P06727 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA4P06727 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA4P06727 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA4P06727 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA4P06727 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA4P06727 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA4P06727 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA4P06727 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA4P06727 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA4P06727 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA4P06727 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA4P06727 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA4P06727 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA4P06727 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA4P06727 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA4P06727 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA4P06727 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA4P06727 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA4P06727 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA4P06727 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA4P06727 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA4P06727 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
APOA4P06727 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA4P06727 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA4P06727 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA4P06727 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA4P06727 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA4P06727 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA4P06727 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA4P06727 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA4P06727 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA4P06727 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA4P06727 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA4P06727 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA4P06727 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA4P06727 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA4P06727 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA4P06727 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA4P06727 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA4P06727 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA4P06727 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA4P06727 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA4P06727 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA4P06727 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA4P06727 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA4P06727 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA4P06727 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA4P06727 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA4P06727 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA4P06727 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA4P06727 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA4P06727 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms