Protein–RNA interactions for Protein: O95992

CH25H, Cholesterol 25-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CH25HO95992 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CH25HO95992 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CH25HO95992 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CH25HO95992 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CH25HO95992 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CH25HO95992 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CH25HO95992 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CH25HO95992 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CH25HO95992 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CH25HO95992 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CH25HO95992 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CH25HO95992 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CH25HO95992 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CH25HO95992 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CH25HO95992 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CH25HO95992 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CH25HO95992 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CH25HO95992 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CH25HO95992 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CH25HO95992 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CH25HO95992 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CH25HO95992 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CH25HO95992 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CH25HO95992 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CH25HO95992 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CH25HO95992 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CH25HO95992 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CH25HO95992 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CH25HO95992 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CH25HO95992 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CH25HO95992 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CH25HO95992 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CH25HO95992 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CH25HO95992 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CH25HO95992 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CH25HO95992 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CH25HO95992 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CH25HO95992 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CH25HO95992 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CH25HO95992 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CH25HO95992 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CH25HO95992 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CH25HO95992 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CH25HO95992 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CH25HO95992 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CH25HO95992 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CH25HO95992 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CH25HO95992 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CH25HO95992 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CH25HO95992 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CH25HO95992 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CH25HO95992 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CH25HO95992 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CH25HO95992 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CH25HO95992 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CH25HO95992 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CH25HO95992 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CH25HO95992 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CH25HO95992 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CH25HO95992 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CH25HO95992 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CH25HO95992 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CH25HO95992 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CH25HO95992 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CH25HO95992 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CH25HO95992 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CH25HO95992 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CH25HO95992 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CH25HO95992 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CH25HO95992 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CH25HO95992 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CH25HO95992 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CH25HO95992 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms